Referente: Elia Mario Biganzoli (INT - Università degli Studi di Milano. Direzione: Adriano Decarli)elia.biganzoli@istitutotumori.mi.it
Partecipanti: F. Ciccarelli, IEO, Milano; G. Piaggio, ROC, Roma; G. Lavorgna, HSR, Milano; S. Tommasi, IO, Bari; D. Marconi, CRO, Aviano; S. Giuliani, CINECA, Bologna 
Il Gruppo si prefigge di promuovere l'uso di strumenti bioinformatici e di svilupparli tramite le tecnologie informatiche e telematiche più innovative con l’obiettivo di migliorare l’efficienza e la qualità dell’analisi in-silico; intende inoltre coordinare le attività di ricerca e sviluppo su tematiche specifiche di ricerca e cliniche che possano portare all’ideazione di nuovi strumenti bioinformatici, la cui realizzazione possa essere portata a termine in progetti finalizzati, finanziati su nuovi bandi nazionali e internazionali.
Il Gruppo intende organizzare e svolgere corsi relativi all'uso di strumenti bioinformatici e tecnologie ICT più innovative per il loro sviluppo, nonché seminari e workshop nei quali saranno presentati i risultati delle attività svolte dai partner nell’ambito della rete; si prefigge inoltre la messa in comune, sul sito web del progetto, di strumenti bioinformatici, software e database, in supporto all’oncologia clinica e sperimentale, evidenziando competenze e strumenti sviluppati dai ricercatori della rete, garantendone il mantenimento e l’aggiornamento costante. Intende infine sviluppare collaborazioni con gestori di servizi di High Performance Computing e infrastrutture di rete avanzate (Grid) per l'accesso e l'utilizzo degli stessi, a partire dalle collaborazioni già in atto, e prevedendone, ove possibile, l’allargamento ai partner e agli Istituti di ACC.
Il gruppo intende mettere a confronto esperienze e competenze diverse su argomenti di comune interesse, configurandosi come punto di incontro tra bioinformatici, biostatistici, biologi e clinici e favorendo ogni iniziativa diretta al dialogo di dette figure. La partecipazione ai gruppi potrà essere estesa su invito.
Verrà effettuata inoltre un’indagine per valutare le necessità di supporto metodologico biostatistico e bioinformatico alla ricerca “omica” condotta nel contesto del consorzio RNBIO. L’indagine sarà mirata alla ricognizione del grado di formazione e competenza metodologica statistica con riferimento alle metodologie di pianificazione di esperimenti ed analisi di dati highthroughput. L’indagine potrà essere separatamente estesa esternamente ad RNBIO su base di partecipazione volontaria.
Il gruppo di lavoro collaborerà strettamente con gruppi e società scientifiche nazionali ed internazionali, quali il Gruppo di Lavoro di Biostatistica Informatica della Società Italiana di Biometria con il quale si prevede la co-organizzazione di seminari, simposi autonomi e sessioni in conferenze nazionali ed internazionali.
Come attività di sviluppo scientifico si prevede il contributo alla realizzazione di consorzi nazionali che integrino competenze di eccellenza sui fronti biomolecolari, bioinformatici e biostatistici e che possano essere referenti o partecipanti di proposte progettuali alla Commissione Europea o al NIH USA. Inoltre è prevista la produzione e validazione di nuove metodologie di analisi dei dati come librerie software in linguaggio R o MATLAB.

Obiettivi anno 2009:

• Questionario ed indagine conoscitiva per la valutazione delle necessità di supporto metodologico biostatistico e bioinformatico alla ricerca “omica” interne ai partecipanti a RNBIO.
• Estensione del questionario ed indagine al punto su scala Nazionale per la valutazione delle necessità diffuse.
• Organizzazione di almeno due giornate tecniche dedicate a relazioni scientifiche su temi di interesse metodologico congiunto bioinformatico e biostatistico per RNBIO.
• Organizzazione di almeno un corso intermedio di metodologia bioinformatica e biostatistica e sull’uso e le proprietà di strumenti software per l’analisi di dati omici.
• Conduzione di almeno un progetto pilota per la realizzazione di librerie software in linguaggio R e/o MATLAB per l’analisi di dati omici.
• Costruzione di almeno un progetto di ricerca metodologica sui temi portanti indicati dall’attività dei Gruppi di Lavoro RNBIO dedicati agli aspetti biomedici.